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私自身は人文系修士を出てすでに大学からは離れていますので
COE自体の収入についてははっきりとは知りませんが
要綱等を見る限りでは身分は
学振の特別研究員に準ずるのではないかと思います。
ゆえにここからのお答えは学振についてのものであると
ご承知おきください。

学振は日本学術振興会特別研究員、が正式名称です。
博士課程に進んだのはいいけど
いい年こいて収入の道が閉ざされがちな院生にとっては、
まさに憧れのポストです。
形式的には振興会に雇われるという形なのですが
別に振興会という研究機関が実在するのではなく
「あなたのいる場所で好きな研究をしてね、こっちはそれにた
いしてお金を払って応援します」というようなものです。
相当の狭き門と言えます。

収入は月20万ちょいで、課税対象です。
ボーナスはないです。
働いたことに対する労い、みたいなものがいわゆるボーナスの
趣旨だと思うんですけど、
このお金はいわば奨学金みたいな性質のものなので出ないのだ
と思われます。
(少ない!と思われるかもしれませんが
特に文系だと30くらいでまともな職がなく、
専門のバイト＆塾講師のバイトのかけもちで
月10数万円の収入しかない人はたくさんいます)

そのほかに年間150万くらいの研究費が出ます。
補助の目的は当然「優秀な研究者に、お金の心配をせずに学問
に打ち込んでもらうこと」です。

ともえごぜんさんが何でそんなこと
(他人の収入がいくらでしかも課税対象なのかとか)
を知りたいのかはわかりませんが、
そのお友達は相当優秀な方ではないでしょうか。
社会人になってお金を稼ぐだけのことなら
たいていの人間には可能でしょうが、
学振に選ばれるというのは簡単なことではありません。
普通に会社に入っても管理職になれるのはごく一部ですが、
いわば彼女はその管理職候補に選ばれた、ということです。

蛇足ながら、本当にお友達なら
そのへん素直に尋ねてみてもよかったのでは?

私も人文科学系の話ですが、

博士課程を終えたいわゆるオーバードクター（つまり博士号を
もってるプー）の知人が誘われたCOE研究員の話は、なんと月給８
０万円でした。
でも任期は１年だったか２年だったか。
そもそも、そのCOE研究費は期間限定の補助金なのです。
多分、２００２年度から２年間じゃなかったかな。
補助金の額は、国から支給される額が機関によって異なります。
また中でどう使うかはそれぞれの機関の自由だからです。（もち
ろん縛りはありますが）
人件費として払われるレベルも様々でしょう。
コピー取りのバイト程度の仕事に学部生を一ヶ月間契約したりと
か、または研究者の卵に期限付きでなにか研究をさせたりなど、
やらせる仕事で当然報酬も違うはずです。
ボーナスという形をとることもおそらく自由でしょうが、しない
でしょう。
人件費に払われたお金には税金がかかります。

えーと、ともえごぜんさんは、どうもそのお友達に「ふんっ、い
ばっちゃって」という面白くない気持ちがあるようですが、一言
解説させてください。

このCOEの補助金というのは実にすごい争奪戦というか、各大学生
き残りをかけたタイヘンに切実な思いのあるお金なのです。
もらえた機関は勝ち組みと目されるような、そういう種類のお金
なのです。
（２００２年度から始まったので、実際にそれほど価値のあるも
のかどうかはまだ分からないのが本当ですが）
その補助金をもらえた数少ない大学の中で、先生から「COE研究員
にならないか」と話をもらえるというのは、研究者のタマゴに
とってはおそらくとってもラッキーかつ名誉なことなのです。
だから、その友達がえらそうになるのも無理ないかな…と。
（あんたの業界でエライからってこっちにまでエラそうにする
なっ！って、話ではありますけどね。）

ま、そのお友達にしてみたら「初めての給与所得生活」なんです
から、うかれるのも大目に見てやってちょーだい、期限付きなん
だしさと、私はそう思いますよ。

研究もお金を貰えば仕事なのか～？って感じなんですかね？

企業の研究室に居る人なら、ともえごぜんさんも「？」とは
思わなかったんだろうし、そのお友達もご自分の給与体系や
税金の事に疎くて質疑応答にならなかったんだろうなぁ・・・
とも思ったりしました。
（普通に勤めてても、税金や控除に関しては疎いものなんですが）

その給与って所得になるなら、翌年の所得税ってどうなるんだ
ろう？所得税って翌年にくるよね。その研究が終わって収入
減った時に大変・・・かも・・・？

きっとそのお友達は、
「いつまでも学生で遊んでられていいよね、長い夏休みもある
し…」という視線を感じていたのかな、と思うのですが。
お友達の専門が何かわかりませんが、特に人文系だとそう思われる
ことが多いし、「休みだから遊んでいていいわけではないから、就
業規則のある人たちより、ある意味大変！！」と言ったって、「で
も好きでやってるんでしょ」って返されがちですし。
だから、「私だって遊んでるだけではなく、お給料もらえているの
よ」って自慢したくなってしまったのではないかと。
21世紀COEに関しては知りませんでしたが、学振に匹敵するような
ものだと思うし、その研究員となったお友達は、とても努力した人
だと思います。
まあ、今までの努力が実って、お給料もらえるようになったのね～
って、温かい目で見てあげるのがよいかと・・・
勘違い意見だったらごめんなさい。

コベントさん、たんきいさん、momo2000さん、あらじん2001さ
ん、とても詳しいお話ありがとうございました。

実際、友達に直接いろいろ聞いたのですが、なんだか、あまり要領
を得なかったのです。「私、お金かせいでるわよ」と終始そういう
感じで、ちょっとえらそうだったので、なんだか私も面白くなかっ
たんですよね、確かに。
それと、彼女は、私生活が乱れ気味なのでその辺の要素も織り込ん
で、どうも優秀だとは思えなかったんですよね。

でも、みなさんのお話から、とっても優秀な方しか選ばれないとい
うことから、彼女なりの自負があったのでしょうね。それがわかっ
てよかったです。お互いに、企業に勤める人と研究に打ち込む人で
環境が異なって、私も知識がなく、彼女を理解できなかったのだな
ーと、ちょっと反省してます。

今度会うときは、「研究のほうはどうなの？」と彼女の話もたくさ
ん聞こうと思います。お互い、違うところでがんばっている友達で
すから。